হাওরের বুক চিরে বয়ে গেছে ছোট বড় অনেক নদী। তন্মধ্যে ভারতের সাথে অভিন্ন নদী খোয়াইসহ পুরাতন কুশিয়ারা, রত্না, শুটকী, ঝিংড়ি, বেড়ামোহনা ইয়ারা ও শাখা বরাক উলেস্নখযোগ্য। খোয়াই নদী ভারতের ত্রিপুরা রাজ্যের আথারমুড়া পর্বতমালার জলধারা থেকে উৎপত্তি হয়ে ত্রিপুরা রাজ্যের খোয়াই শহর ঘেষে হবিগঞ্জের চুনারম্নঘাট উপজেলার বালস্না সীমামত্ম দিয়ে বাংলাদেশে প্রবেশ করে। অপেক্ষাকৃত উত্তর পশ্চিমে বয়ে হবিগঞ্জ শহরের বুক চিরে বানিয়াচং উপজেলার দক্ষিণ হাওরগুলোতে বয়ে মিঠামইন উপজেলার কালনী নদীর সাথে মিশেছে। কালনী-কুশিয়ারা নদীর একটি শাখা পুরাতন কুশিয়ারা। নবীগঞ্জের শেরপুর অঞ্চল হতে নবীগঞ্জের ভাটিতে বয়ে উত্তর হাওর হয়ে আজমিরীগঞ্জে কালনী নদীতে মিলিত হয়েছে। অন্যান্য নদীগুলো এ নদীর শাখাপ্রশাখা।
পরিকল্পনা ও বাস্তবায়নে: মন্ত্রিপরিষদ বিভাগ, এটুআই, বিসিসি, ডিওআইসিটি ও বেসিস